Bioinformatics Technologies

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Bioinformatics Technologies
by Y.-P. Chen (陳伊萍)




　　生物資訊是一項跨領域的學門，對於生醫領域的學生或是研究生，如何跨到資訊科學領域從事生物資訊研究，往往是一項很大的阻礙。因此，一本好的入門書籍將會有很大的幫助。「Bioinformatics Technologies」這本書是一個不錯的選擇。



　　「Bioinformatics Technologies」作者Yi-Ping Phoebe Chen (陳伊萍)，是位台灣台北出生的女科學家，目前任職於澳洲Deakin University資訊工程學系，同時也是Deakin University生物資訊研究中心主持人。除此之外，她也擔任許多生物資訊國際研討會主席與委員，例如APBC (Asia-pacific Bioinformatics Conference)、GIW (Conference on Genome Informatics)和ISMB (International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology)知名國際會議等，由此可知她在學術上的成就。

　　此書有幾個適合成為入門書的特色。通常一位生醫領域的學生，看到一堆數學方程式，往往會感到害怕，因而失去深入研讀的動力。此書的第一個特色，就是沒有繁瑣的數學方程式，而是藉由圖表介紹資訊技術(information technology, IT)的理論與觀念。另外一個特色，此書幾乎涵蓋現有生物資訊領域所應用到資訊技術，包括資料庫系統(database system)、機器學習(machine learning)、統計模型(statistical model)等，並提出目前這些方法所遭遇到的挑戰，對於想要針對生物資訊方法學有深入研究的學生，是一個很好的指引。

　　從事生物資訊的研究，首先要先知道「資訊」在哪裡，因此，此書一開始就先介紹各種生物資訊常用的資料庫與資料型態，以及如何處理這些資料。接著，介紹常見的資訊技術，有資料探採(data mining)與機器學習，以及在生物資訊領域的應用，例如：序列模組探採(motif mining)的應用。另外介紹各種不同「-ome」的資料與技術，包括基因體學(genome)、轉錄體學(transcriptome)、蛋白質體學 (proteome)與代謝體學(metabolome)，並說明不同型態資料整合的方法與重要性。最後，介紹的是生物學家較熟悉的微陣列資料分析的方法與原理。另外在各章節中，也分別介紹常用的工具，以供參考。

　　此書雖然只有不到四百頁的內容，但是涵蓋了現有的技術介紹。然而，此書美中不足之處在於圖片的解析度太低，許多地方圖片中的文字太過模糊。即便如此，此書仍不失為跨進資訊領域的入門書籍。









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Published on: 2007-07-06 (5 reads)